划要点:
- 1这篇论文从“全球同享流感数据建议安排”中提取了160个世界各地的新冠病毒组成了体系进化网络。
- 2他们发现全球感染人类的病毒可分为ABC三个类群。A群新冠病毒,是在人类社会里传达的最原始的病毒,A型病毒并没有在武汉和我国大规模地呈现,更多呈现在美国和澳大利亚。B群新冠病毒,被以为是经过A群骤变而来,散布以亚洲为主,可是亚洲以外的每个B群都进化出了骤变;而C群冠状病毒被以为是B群骤变而来,在我国大陆不存在,首要在欧洲散布。
- 3为何A型病毒并没有在武汉和我国大规模地呈现,这或许是由于A型并不习惯当地人的免疫体系,所以才变异成了B型,但也或许是由于当地更多的病例是由B型感染者感染出去的,即遗传学上的“奠基者效应”(founder effect)。
- 4其实,这篇论文自身其实并没有直接回复咱们都关怀的问题“新冠病毒是来历于美国,仍是我国”。据悉,作者现已更新了他们的样本至1000例,但现在没有经过同行评议宣布出来。
- 5关于病毒的来历,我国的学者也发布过不少论文,剑桥大学这篇研讨简直是在重复我国学者的作业,正如欧美的防疫一步步验证我国现已验证的问题(比方戴口罩、加强阻隔等)。
一场新冠病毒疫情,始于2019年年末,完毕好像还遥遥无期,还有愈演愈烈之势。
可是,这次疫情源头是哪儿,一向备受重视。
近来,一项来自剑桥大学遗传学家彼得·福斯特(Peter Forster)博士团队的研讨引发热议,他们重新冠患者别离的榜首批160个完好基因组序列剖析发现,新冠病毒来历或许来自美国和澳大利亚,而不是我国武汉患者。
(剑桥大学新冠病毒进化研讨引发争议。来历:剑桥大学官网)
无独有偶。4月10日,国家卫健委高等级专家组成员、我国疾控中心流行病学首席科学家曾光教授承受媒体采访,谈及海外疫情时也表明:“假如(疫情)没有控制住,只能阐明两个问题:一是或许除了武汉以外,还有其他源地,咱们没有发现,或许在国外还有;另一个问题,或许是由于他们防疫办法不到位。”
(曾光教授判别,病毒源头不扫除来自国外的或许性。来历:中新视频)
新冠病毒的来历,现已成了一个“棘手的山芋”,它究竟来自哪里,咱们一块儿来看看。
新冠病毒源自哪里?
3月30日,剑桥大学研讨人员在《美国科学院院刊》(PANS)以“Contributed”( 注:Contributed的一种机制,即可经过院士内推宣布论文。)的方式宣布了一篇针对病毒溯源的研讨,他们发现全球的新冠病毒现已变异为A、B、C三品种型,而且这三品种型的病毒在全球散布规模各不相同[1]。
(英国剑桥大学研讨人员关于新冠病毒进化的研讨快速宣布。来历:PNAS官网)
细心看来,这篇论文沿用了我国武汉病毒研讨所石正丽团队发现的BatCovRaTG13病毒[2](即新冠病毒在动物中的”先人”)作为源头,从“全球同享流感数据建议安排”(GISAID)中提取了160个世界各地的新冠病毒组成了体系进化网络。
(经过全球不同区域来历新冠病毒基因组做出的进化树。来历:剑桥团队研讨[1])
A群新冠病毒,是在人类社会里传达的最原始的病毒,上图可以精确的看出:A群在我国、东亚、美国、澳大利亚、欧洲均有散布。
这项进化剖析研讨的作者将A群分为了两个亚群:
T-等位基因亚群中,有4个我国人(来自我国广东省)带有先人基因组,而3名日本人和两名美国患者则有许多骤变,据报道,这些美国患者有曾在武汉疑似疫情爆发地的寓居史;
C-等位基因亚群,这中心还包含来自武汉的5个人(有两个带着先人基因),别的8个来自我国其他区域和附近国家的东亚人,该亚群有近一半(15/33)首要坐落美国和澳大利亚。
(剑桥新冠病毒进化研讨对病毒来历的剖析。来历:剑桥团队研讨[1])
B群新冠病毒,被以为是经过A群骤变而来,散布以亚洲为主(93个里边占74个),我国武汉22例,东部其他区域31例。较早的B群彻底在东亚传达(共26个),可是亚洲以外的每个B群都进化出了骤变(共19个),作者以为这种现象或许不是由于B群在我国传达而自然发生的骤变导致的,而是由于B群自身习惯了亚洲人群,需求再次骤变以习惯欧美人群。
而C群冠状病毒被以为是B群骤变而来,在我国大陆不存在,首要在欧洲散布(11例),新加坡有5例,我国香港、我国台湾和韩国也有。
该论文作者还谈论了病毒在欧美的传达链条:
巴西的榜首例患者是拜访意大利后感染的,其病毒归于C群;
墨西哥的病毒也是意大利来历的,是2020年2月28日在墨西哥的意大利游览者身上被检测出来;
意大利的病毒源头是德国,一位在慕尼黑Webasto公司作业的职工。
结合上述信息,这篇论文自身并没有回复咱们都关怀的问题“新冠病毒是来历于美国,仍是我国”。
据悉,作者现已更新了他们的样本至1000例,但现在没有经过同行评议宣布出来。
然后,论文作者Peter Forster博士承受了环球时报正直哥采访表明[3],不论是哪篇论文,现在仍无法就病毒的来历地给出一个清晰的答案。
他对A族群的散布问题,也做出了回应:
“为何A型病毒并没有在武汉和我国大规模地呈现,这或许是由于A型并不习惯当地人的免疫体系,所以才变异成了B型。但也或许是由于,武汉当地更多的病例是由B型感染者感染出去的,即遗传学上的“奠基者效应”(founder effect)。”
至于A型为何更多呈现在美国和澳大利亚,他以为这有或许是由于A型更习惯那里人的免疫体系。
可是,A型在武汉呈现过,感染过一些武汉人,也感染过有武汉寓居游览史的美国人。
所以,从现有依据来看,美国的A型病毒依然或许是从武汉寓居史这个途径曩昔的。而并不是有些人猜想的“来历于美国”。
(Peter Forster博士回应正直哥采访原文。来历:环球时报谈论[3])
“病毒源自美国”真的实锤了吗?
事实上,关于病毒的来历,我国的学者也发布过不少论文,剑桥大学这篇研讨简直是在重复我国学者的作业。正如欧美的防疫,一步步验证了我国现已验证过的问题(比方戴口罩、加强阻隔等)。
2月21日,国内的预印本网站ChinaXiv上曾宣布过一篇论文,也是将新冠病毒分为了三个族群。
(国内学者2月份宣布的新冠病毒进化传达研讨。来历:ChinaXiv[4])
其时,这篇论文首要的热门会集在破除了“病毒源自华南海鲜商场”的认知,但咱们细心阅读下来就会发现,剑桥大学的研讨简直和该论文千篇一律。
(国内学者2月份新冠病毒进化传达研讨里的全球散布地图。来历:ChinaXiv[4])
可以正常的看到,相同的有A、B、C三个族群,不过我国学者是以B群为最前期的病毒群;
然后来我国学者这篇论文,被台湾某节目引证论说是否源自美国而大火,腾讯医典此前也曾专门做过解读:
美国虽然有更多的病毒品种,可是大多数都与我国患者有关:患者要么到过我国,要么在我国以外的国家触摸过我国的患者。
(美国确诊病例散布和溯源。来历:美国CDC[5])
因而,剖析了这么多,源头究竟是哪儿?现在暂未可知。
不过,从渐渐的变多的研讨追溯发现,中心宿主或许是散布在东南亚国家的马来西亚穿山甲,病毒的来历或许不是我国。
寻觅真实的源头是科学问题,也是让相似的疫情不会再次演出的首要的要素,咱们就让子弹再持续飞一会吧。
参考文献
[1] Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, et al. Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes. PANS. 2020.
[2] Zhou P, Yang XL, Wang XG, et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020, 579(7798):270-273.
[3] 环球时报新媒体. 《这篇论文,能阐明“病毒并非来自我国,而是美国吗”?》
https://view.inews.qq.com/a/20200411A0627T00
[4] Yu WB, Tang GD, Zhang L, et al. Decoding evolution and transmissions of novel pneumonia coronavirus using the whole genomic data. ChinaXiv. 2020:202002.00033.
[5] https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/cases-in-us.html
【主创团队】
作者:蒋永源:知乎大V@阿源教师 第三军医大学内科学硕士
修改:叶正兴、王凤灵、乔辉
排版:周舟
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